Structural complexity of the white flower locus in Chrysanthemum

The Journal of Horticultural Science and Biotechnology 100 巻 1 号 82-91 頁 2024-06-25 発行
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利用開始日 2025-06-25 3.11 MB 種類 : 全文 エンバーゴ : 2025-06-25
タイトル ( eng )
Structural complexity of the white flower locus in Chrysanthemum
作成者
Toyokura Kouichi
Abe Tomoko
Higuchi Yohei
Arens Paul
Shibata Michio
収録物名
The Journal of Horticultural Science and Biotechnology
100
1
開始ページ 82
終了ページ 91
抄録
The white flower trait in Chrysanthemum is attributed to the carotenoid cleavage dioxygenase 4a gene (CCD4a), a key domestication gene that contributed to generation of various flower colours in modern chrysanthemum cultivars. This trait is believed to be controlled by a single dominant locus. We studied the structure of this CCD4a locus utilising the whole genome sequence information of Chrysanthemum makinoi, a diploid white flower species, and found six homologous sequences of CCD4a, two of which being functional, and arranged in tandem in a 586-kb region on Chromosome 7. A qPCR analysis disclosed that white flower Chrysanthemum species possess at least two and as many as eight copies of CCD4a homologous sequences per monoploid genome, indicating high polymorphism of the CCD4a region. A detailed analysis of the structural diversity of the CCD4a region in Chrysanthemum could provide significant insights into the domestication trajectory of the cultivated chrysanthemum.
著者キーワード
Flower colour
gene copy number
domestication
carotenoid cleavage dioxygenase
retrotransposon
内容記述
This work was supported by JSPS KAKENHI under Grants [26292014] to M.S and [24H00513] to M.K, and TKI-T&U project [LWV22014] to P.A.
言語
英語
資源タイプ 学術雑誌論文
出版者
Taylor & Francis
発行日 2024-06-25
権利情報
This is an Accepted Manuscript of an article published by Taylor & Francis in The Journal of Horticultural Science and Biotechnology on 25 Jun 2024, available at: https://doi.org/10.1080/14620316.2024.2371596.
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この論文は出版社版ではありません。引用の際には出版社版をご確認、ご利用ください。
出版タイプ Accepted Manuscript(出版雑誌の一論文として受付されたもの。内容とレイアウトは出版社の投稿様式に沿ったもの)
アクセス権 エンバーゴ期間中
収録物識別子
[DOI] https://doi.org/10.1080/14620316.2024.2371596 ~の異版である
助成機関名
日本学術振興会
Japan Society for the Promotion of Science
助成機関識別子
[Crossref Funder] https://doi.org/10.13039/501100001691
研究課題名
キク属植物におけるカロテノイド酸化開裂酵素遺伝子CCD4の多様性の解析
Analysis of the diversity of carotenoid cleavage dioxygenase genes (CCD4s) in Chrysanthemum
研究課題番号
26292014
助成機関名
日本学術振興会
Japan Society for the Promotion of Science
助成機関識別子
[Crossref Funder] https://doi.org/10.13039/501100001691
研究課題名
キク属モデル系統と種間交雑を基軸としたキク属重要形質の分子遺伝学的解剖
キク属モデル系統と種間交雑を基軸としたキク属重要形質の分子遺伝学的解剖
研究課題番号
24H00513
備考 The full-text file will be made open to the public on 25 June 2025 in accordance with publisher's 'Terms and Conditions for Self-Archiving'