A Semantic Similarity Measurement Method Based on Information Quality in the Structure of the Gene Ontology
5th International Workshop on Computational Intelligence & Applications Proceedings : IWCIA 2009
117-121 頁
2009-11 発行
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| ファイル情報(添付) | |
| タイトル ( eng ) |
A Semantic Similarity Measurement Method Based on Information Quality in the Structure of the Gene Ontology
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| 作成者 |
Hirai Junya
Nishizaki Ichiro
Hayashida Tomohiro
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| 収録物名 |
5th International Workshop on Computational Intelligence & Applications Proceedings : IWCIA 2009
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| 開始ページ | 117 |
| 終了ページ | 121 |
| 抄録 |
Gene ontology (GO) which described a biological concept of gene has attracted attention as an index for measuring semantic similarity of gene. This paper considers a new method for measuring the semantic similarity of GO through an extension and combination of two existing methods by Resnik and Wang et al. in order to improve their drawbacks of effects of shallow annotation. It is shown that the proposed method is superior to existing methods through experiments with pathway data.
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| 著者キーワード |
gene ontology
semantic similarity
pathway
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| NDC分類 |
技術・工学 [ 500 ]
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| 言語 |
英語
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| 資源タイプ | 会議発表論文 |
| 出版者 |
IEEE SMC Hiroshima Chapter
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| 発行日 | 2009-11 |
| 権利情報 |
(c) Copyright by IEEE SMC Hiroshima Chapter.
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| 出版タイプ | Version of Record（出版社版。早期公開を含む） |
| アクセス権 | オープンアクセス |
| 収録物識別子 |
[ISSN] 1883-3977
[URI] http://www.hil.hiroshima-u.ac.jp/iwcia/2009/
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