A mobility-shift detection method for DNA methylation analysis using phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophoresis
Analytical Biochemistry 378 巻 1 号
102-104 頁
2008-07-01 発行
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| ファイル情報(添付) | |
| タイトル ( eng ) |
A mobility-shift detection method for DNA methylation analysis using phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophoresis
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| 作成者 |
Kinoshita-Kikuta Emiko
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| 収録物名 |
Analytical Biochemistry
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| 巻 | 378 |
| 号 | 1 |
| 開始ページ | 102 |
| 終了ページ | 104 |
| 抄録 |
Herein, we describe a procedure for DNA methylation analysis using the bisulfite-mediated C-to-U conversion of a target DNA followed by methylation-specific polymerase chain reaction (MSP) and phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). The MSP was performed using a 1:1 mixture of 5'-phosphorylated methylation-specific and 5'-OH non-methylation-specific primers. The PAGE using an immobilized phosphate-binding tag molecule (i.e., a polyacrylamide-bound dizinc(II) complex, Zn2+–Phos-tag), which selectively captures the 5'-phosphorylated DNA fragment, enabled the mobility-shift detection of the methylation-specific product as a slower migration band. Using this novel procedure, we demonstrated the detection of a methylated cytosine base in a pUC19 plasmid.
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| 著者キーワード |
DNA methylation; Epigenetics
Methylation-specific PCR
Phosphate-affinity PAGE
Phos-tag
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| NDC分類 |
医学 [ 490 ]
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| 言語 |
英語
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| 資源タイプ | 学術雑誌論文 |
| 出版者 |
Academic Press Inc.
Elsevier Science
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| 発行日 | 2008-07-01 |
| 権利情報 |
Copyright (c) 2008 Elsevier Inc.
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| 出版タイプ | Author’s Original（十分な品質であるとして、著者から正式な査読に提出される版） |
| アクセス権 | オープンアクセス |
| 収録物識別子 |
[ISSN] 0003-2697
[DOI] 10.1016/j.ab.2008.03.021
[NCID] AA00524867
[DOI] http://dx.doi.org/10.1016/j.ab.2008.03.021
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