Zinc(II)-cyclen polyacrylamide gel electrophoresis for detection of mutations in short Ade/Thy-rich DNA fragments
Analytical Biochemistry 408 巻 2 号
348-350 頁
2011-01-15 発行
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| ファイル情報(添付) | |
| タイトル ( eng ) |
Zinc(II)-cyclen polyacrylamide gel electrophoresis for detection of mutations in short Ade/Thy-rich DNA fragments
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| 作成者 |
Kinoshita-Kikuta Emiko
Harada Naoko
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| 収録物名 |
Analytical Biochemistry
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| 巻 | 408 |
| 号 | 2 |
| 開始ページ | 348 |
| 終了ページ | 350 |
| 抄録 |
We describe an improved gel-based method with an additive Zn2+-cyclen complex (cyclen, 1,4,7,10-tetraazacyclododecane), Zn2+-cyclen-PAGE, for mutation detection in DNA fragments by PCR that contain more than 65% Ade/Thy bases and fewer than 100 base pairs (bp). Existing techniques have a problem in analyzing such short Ade/Thy-rich fragments because the duplexes are disrupted and are not detectable due to binding of Zn2+-cyclen to Thy bases. In this strategy using a PCR primer with a Gua/Cyt-lined sequence attached at its 5'-end, we successfully detected a mutation in an 86-bp Ade/Thy-rich region of the BRCA1 gene from formalin-fixed paraffin-embedded breast cancer-tissue sections.
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| 著者キーワード |
Zn2+-cyclen
PAGE
SNP
Mutation
FFPE
BRCA1
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| NDC分類 |
医学 [ 490 ]
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| 言語 |
英語
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| 資源タイプ | 学術雑誌論文 |
| 出版者 |
Academic Press Inc Elsevier Science
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| 発行日 | 2011-01-15 |
| 権利情報 |
Copyright (c) 2010 Elsevier Inc
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| 出版タイプ | Author’s Original（十分な品質であるとして、著者から正式な査読に提出される版） |
| アクセス権 | オープンアクセス |
| 収録物識別子 |
[ISSN] 0003-2697
[DOI] 10.1016/j.ab.2010.09.003
[NCID] AA00524867
[DOI] http://dx.doi.org/10.1016/j.ab.2010.09.003
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